Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC93Q567U6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms