Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YSP2YDR326C 4317 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 DSE4YNR067C 3354 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YJL016WYJL016W 1686 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 SNX41YDR425W 1878 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 RGC1YPR115W 3252 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YDL180WYDL180W 1644 nt3.52□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 ADK1YDR226W 669 nt3.51□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 LCL2YLR104W 396 nt3.51□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 UBC7YMR022W 498 nt3.51□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 MSL5YLR116W 1431 nt3.51□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 PSY2YNL201C 2577 nt3.51□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YDL068WYDL068W 330 nt3.5□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.5□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YGR035CYGR035C 351 nt3.5□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.5□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 SSE1YPL106C 2082 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YFL065CYFL065C 309 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 RNP1YLL046C 750 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 AYT1YLL063C 1425 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 BRO1YPL084W 2535 nt3.49□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YDR250CYDR250C 276 nt3.48□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 HYR1YIR037W 492 nt3.48□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YOR105WYOR105W 327 nt3.48□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 PUF6YDR496C 1971 nt3.47□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.47□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 PUF4YGL014W 2667 nt3.47□□□□□ -1.85
SSF2Q12153 NPR3YHL023C 3441 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YME2YMR302C 2553 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 ECM21YBL101C 3354 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 BMH2YDR099W 822 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YHL005CYHL005C 393 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YIL054WYIL054W 318 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 MGR1YCL044C 1254 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 ITC1YGL133W 3795 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 MSS11YMR164C 2277 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 NMD2YHR077C 3270 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YPK1YKL126W 2043 nt3.46□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 HEH2YDR458C 1992 nt3.45□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 TLC1TLC1 1301 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 SPO14YKR031C 5052 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 GYP7YDL234C 2241 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 RGR1YLR071C 3249 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 PSO2YMR137C 1986 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YKL136WYKL136W 399 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 MET6YER091C 2304 nt3.44□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 NET1YJL076W 3570 nt3.43□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 NUP82YJL061W 2142 nt3.43□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 snR76snR76 109 nt3.43□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 AST2YER101C 1293 nt3.43□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 TPS2YDR074W 2691 nt3.43□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 CSR2YPR030W 3366 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 MBB1YJL199C 327 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 NCE101YJL205C 162 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 NAB3YPL190C 2409 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YPL216WYPL216W 3309 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YIL169CYIL169C 2988 nt3.42□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 STT4YLR305C 5703 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 ROG1YGL144C 2058 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 SKT5YBL061C 2091 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 URM1YIL008W 300 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 GPI14YJR013W 1212 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 RAM2YKL019W 951 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 RPS1AYLR441C 768 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YLR458WYLR458W 381 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 VTI1YMR197C 654 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YOR199WYOR199W 330 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 ATP15YPL271W 189 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 YJR003CYJR003C 1560 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 FRE2YKL220C 2136 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 COX1Q0045 1605 nt3.41□□□□□ -1.86
SSF2Q12153 HMF1YER057C 390 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YML009C-AYML009C-A 327 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL6AYML073C 531 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 PRE8YML092C 753 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 TRM7YBR061C 933 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YBR197CYBR197C 654 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RIF1YBR275C 5751 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 FLO1YAR050W 4614 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 DBP7YKR024C 2229 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 MSB2YGR014W 3921 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 VPS52YDR484W 1926 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RSN1YMR266W 2862 nt3.4□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YDL041WYDL041W 354 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL27BYDR471W 411 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL23BYER117W 414 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 COA4YLR218C 453 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPS22BYLR367W 393 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 BUD4YJR092W 4344 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 SKP2YNL311C 2292 nt3.39□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 AYR1YIL124W 894 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 SMA2YML066C 1110 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 RPL20AYMR242C 519 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 EGD1YPL037C 474 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 YPL238CYPL238C 390 nt3.38□□□□□ -1.87
SSF2Q12153 JIP5YPR169W 1479 nt3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 108.5 ms