Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK1A1P48729 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms