Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARFGEF2Q9Y6D5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF2Q9Y6D5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF2Q9Y6D5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms