Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CGGBP1Q9UFW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CGGBP1Q9UFW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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