Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 SUI1YNL244C 327 nt4.39□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 VHC1YBR235W 3363 nt4.39□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 DNM1YLL001W 2274 nt4.39□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.39□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 ELM1YKL048C 1923 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YLL007CYLL007C 1998 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 AUA1YFL010W-A 285 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 NTC20YBR188C 423 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YBR224WYBR224W 516 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 VAS1YGR094W 3315 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 VPS53YJL029C 2469 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YJL206CYJL206C 2277 nt4.38□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 TRS85YDR108W 2097 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 CLF1YLR117C 2064 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 DPB11YJL090C 2295 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 BEM4YPL161C 1902 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 MIP6YHR015W 1980 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 RIM20YOR275C 1986 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 RPS26BYER131W 360 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YBL028CYBL028C 321 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 HMG1YML075C 3165 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 VAC14YLR386W 2643 nt4.37□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 RPS27BYHR021C 249 nt4.36□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YKL111CYKL111C 336 nt4.36□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt4.36□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 ECM22YLR228C 2445 nt4.36□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YKL222CYKL222C 2118 nt4.36□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 PSF1YDR013W 627 nt4.35□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 GPI1YGR216C 1830 nt4.35□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 SED4YCR067C 3198 nt4.34□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt4.34□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 snR17bsnR17b 332 nt4.34□□□□□ -1.71
SRF1Q12516 CDC15YAR019C 2925 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 TEL1YBL088C 8364 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 snR7-SsnR7-S 179 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 ARF1YDL192W 546 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RPS24AYER074W 408 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YHR210CYHR210C 1026 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 COX19YLL018C-A 297 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RPL37AYLR185W 267 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 ISM1YPL040C 3009 nt4.33□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 PEX8YGR077C 1770 nt4.32□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 BIT61YJL058C 1632 nt4.32□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RPS18AYDR450W 441 nt4.32□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YEL1YBL060W 2064 nt4.32□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 SSP1YHR184W 1716 nt4.32□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 VIP1YLR410W 3441 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 EBS1YDR206W 2655 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RPO21YDL140C 5202 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YHL041WYHL041W 450 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 PCC1YKR095W-A 267 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 FBP1YLR377C 1047 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YMR321CYMR321C 318 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 NAN1YPL126W 2691 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YLR001CYLR001C 2589 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 CHL1YPL008W 2586 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 PIN4YBL051C 2007 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 MDR1YGR100W 2853 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 DIP2YLR129W 2832 nt4.31□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 NRP1YDL167C 2160 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RED1YLR263W 2484 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 ATP22YDR350C 2055 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 SNU13YEL026W 381 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 HPA3YEL066W 540 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RRT15YLR162W-A 189 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YPR063CYPR063C 423 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 PRP42YDR235W 1635 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 TRM2YKR056W 1920 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 SKG6YHR149C 2205 nt4.3□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 MDM20YOL076W 2391 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 SPT10YJL127C 1923 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 AXL2YIL140W 2472 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 RPL32YBL092W 393 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YOR015WYOR015W 360 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 CYM1YDR430C 2970 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 REB1YBR049C 2433 nt4.29□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 SRP68YPL243W 1800 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 MES1YGR264C 2256 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YGL217CYGL217C 342 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 LDS2YOL047C 1071 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 UBP5YER144C 2418 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 FRE4YNR060W 2160 nt4.28□□□□□ -1.72
SRF1Q12516 YKL050CYKL050C 2769 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 VID22YLR373C 2706 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 POG1YIL122W 1056 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 PAU23YLR037C 375 nt4.27□□□□□ -1.73
SRF1Q12516 TRM7YBR061C 933 nt4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.4 ms