Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YAR010CYAR010C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YML040WYML040W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YML045W-AYML045W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YMR051CYMR051C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 COS7YDL248W 1152 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDR124WYDR124W 975 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 MSA2YKR077W 1092 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YAR075WYAR075W 474 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 AI1Q0050 2505 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SPR3YGR059W 1539 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 RPL16AYIL133C 600 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SMD3YLR147C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 MED11YMR112C 396 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 CTK1YKL139W 1587 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 PCL6YER059W 1263 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 TRM2YKR056W 1920 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 APL1YJR005W 2103 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YDL186WYDL186W 834 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YEL075CYEL075C 369 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YER119C-AYER119C-A 372 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YBL028CYBL028C 321 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 snR11snR11 258 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 SPC29YPL124W 762 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 MNL2YLR057W 2550 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YCS4YLR272C 3531 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YOR314WYOR314W 330 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 KAP120YPL125W 3099 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 VMA5YKL080W 1179 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YBL029WYBL029W 1131 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 CAF20YOR276W 486 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BRQ12193 MLH3YPL164C 2148 nt1.03□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 HAP4YKL109W 1665 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 CTF18YMR078C 2226 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YIL082WYIL082W 873 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 STE5YDR103W 2754 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YGL242CYGL242C 546 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 OMA1YKR087C 1038 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 PDS5YMR076C 3834 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 SPO74YGL170C 1242 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 RSM26YJR101W 801 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 LDH1YBR204C 1128 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 DPB3YBR278W 606 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 FIP1YJR093C 984 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YLR053CYLR053C 327 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 GPN3YLR243W 819 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YDL050CYDL050C 372 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 ZRG8YER033C 3231 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YDR355CYDR355C 303 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 BNA7YDR428C 786 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 RRT15YLR162W-A 189 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 HUL5YGL141W 2733 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 RPL31AYDL075W 342 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 FSH1YHR049W 732 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YPL035CYPL035C 348 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 PCL9YDL179W 915 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 YDR132CYDR132C 1488 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BRQ12193 RKR1YMR247C 4689 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 ERV14YGL054C 417 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YGR290WYGR290W 444 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MMF1YIL051C 438 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 SUI2YJR007W 915 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 RNP1YLL046C 750 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 RGM1YMR182C 636 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 TRM12YML005W 1389 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 CRD1YDL142C 852 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 UBC13YDR092W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 PRM4YPL156C 855 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MRP2YPR166C 348 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YKL177WYKL177W 339 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 NCL1YBL024W 2055 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YPL238CYPL238C 390 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 ESC2YDR363W 1371 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MON1YGL124C 1935 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 GCD2YGR083C 1956 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YGR273CYGR273C 525 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 CPR3YML078W 549 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 UBX4YMR067C 1251 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 AIM36YMR157C 768 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BRQ12193 MFB1YDR219C 1398 nt0.93□□□□□ -2.26
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