Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 RIO2YNL207W 1278 nt2.02□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 MIX23YBL107C 591 nt2.02□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 VID24YBR105C 1089 nt2.02□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 MSL5YLR116W 1431 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YCR108CYCR108C 192 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 GCN4YEL009C 846 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 TDA2YER071C 381 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YPS5YGL259W 498 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 ACF4YJR083C 930 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 PDP3YLR455W 915 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 TAZ1YPR140W 1146 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 NPR1YNL183C 2373 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 JIP5YPR169W 1479 nt2.01□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SSE1YPL106C 2082 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 KAR9YPL269W 1935 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 snR5snR5 204 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 RPS17BYDR447C 411 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 FAR7YFR008W 666 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 MRM2YGL136C 963 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YIL082WYIL082W 873 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 RNP1YLL046C 750 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YBL012CYBL012C 402 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 snR43snR43 209 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 RPN3YER021W 1572 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 ATG9YDL149W 2994 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SHE4YOR035C 2370 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 CBF2YGR140W 2871 nt2□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SEC31YDL195W 3822 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YER119C-AYER119C-A 372 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YGL042CYGL042C 306 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 VPS51YKR020W 495 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 NBP1YLR457C 960 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YNL179CYNL179C 438 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YOL150CYOL150C 312 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 TRM7YBR061C 933 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 APL5YPL195W 2799 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YEL043WYEL043W 2871 nt1.99□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 BUD2YKL092C 3315 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 VPS74YDR372C 1038 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SDC1YDR469W 528 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YER189WYER189W 369 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SNO3YFL060C 669 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 PSY1YKL076C 384 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SRP21YKL122C 504 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SNO2YNL334C 669 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 PSK2YOL045W 3306 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 INP53YOR109W 3324 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 MES1YGR264C 2256 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 UBR1YGR184C 5853 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SAC3YDR159W 3906 nt1.98□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SKP2YNL311C 2292 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 NCB2YDR397C 441 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YGL165CYGL165C 579 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 PRS3YHL011C 963 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 RCN1YKL159C 636 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YMR144WYMR144W 1029 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SRL4YPL033C 846 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 MUD1YBR119W 897 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 REF2YDR195W 1602 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 PSO2YMR137C 1986 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 SSF2YDR312W 1362 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 GDI1YER136W 1356 nt1.97□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 ASG1YIL130W 2895 nt1.96□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 ALK2YBL009W 2031 nt1.96□□□□□ -2.09
VIK1Q12045 YNL034WYNL034W 1839 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 STD1YOR047C 1335 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YCL020WYCL020W 1317 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 MPH1YIR002C 2982 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PUT3YKL015W 2940 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 IRC2YDR112W 309 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 ACB1YGR037C 264 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 AIM19YIL087C 474 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PAU14YIL176C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PAU1YJL223C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YKR051WYKR051W 1257 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YMR254CYMR254C 309 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YPL034WYPL034W 498 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 VTC3YPL019C 2508 nt1.96□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PRP6YBR055C 2700 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YDR537CYDR537C 606 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 TMA7YLR262C-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PDR8YLR266C 2106 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 ERG29YMR134W 714 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 HHT2YNL031C 411 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 REV1YOR346W 2958 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 NSL1YPL233W 651 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 INO80YGL150C 4470 nt1.95□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 IPT1YDR072C 1584 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PRK1YIL095W 2433 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.94□□□□□ -2.1
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