Protein–RNA interactions for Protein: Q04214

TY1B-MR1, Transposon Ty1-MR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR1Q04214 CLC1YGR167W 702 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 CAT2YML042W 2013 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YIL082WYIL082W 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 SNX4YJL036W 1272 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 HRT3YLR097C 1035 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YLR140WYLR140W 327 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 SPC29YPL124W 762 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 SRP1YNL189W 1629 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 STE24YJR117W 1362 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YDL186WYDL186W 834 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YGR149WYGR149W 1299 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YLR053CYLR053C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-MR1Q04214 YEL075CYEL075C 369 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 MGE1YOR232W 687 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 SHE3YBR130C 1278 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 DXO1YDR370C 1329 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 MAL33YBR297W 1407 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 VMA5YKL080W 1179 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 SMD3YLR147C 306 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YAR075WYAR075W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YBL028CYBL028C 321 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YIL058WYIL058W 285 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 MED11YMR112C 396 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 PCL6YER059W 1263 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 GPN3YLR243W 819 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YIP3YNL044W 531 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 NOP15YNL110C 663 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 snR11snR11 258 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 DPB3YBR278W 606 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 PDS5YMR076C 3834 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YDL050CYDL050C 372 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 COS7YDL248W 1152 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 OMA1YKR087C 1038 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YDR124WYDR124W 975 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 HTA1YDR225W 399 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YUH1YJR099W 711 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 RIT1YMR283C 1542 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 STE5YDR103W 2754 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 CTF18YMR078C 2226 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 FIP1YJR093C 984 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 RSM26YJR101W 801 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YEL028WYEL028W 462 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YGR290WYGR290W 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 CAF20YOR276W 486 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YOR314WYOR314W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 PCL9YDL179W 915 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YJL211CYJL211C 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 RGM1YMR182C 636 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 GCD2YGR083C 1956 nt0.9□□□□□ -2.26
TY1B-MR1Q04214 YGL242CYGL242C 546 nt0.9□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 MMF1YIL051C 438 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 TRM2YKR056W 1920 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 MLH3YPL164C 2148 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 HUL5YGL141W 2733 nt0.89□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 MSA2YKR077W 1092 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 UBX4YMR067C 1251 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YMR144WYMR144W 1029 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YPL035CYPL035C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YDR355CYDR355C 303 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 SUI2YJR007W 915 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 RRT15YLR162W-A 189 nt0.88□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 IFH1YLR223C 3258 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YBL029WYBL029W 1131 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 MRP2YPR166C 348 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 LDH1YBR204C 1128 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 STB4YMR019W 2850 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 TRM12YML005W 1389 nt0.87□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 ZRG8YER033C 3231 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 DAL5YJR152W 1632 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YDL062WYDL062W 426 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 UBC13YDR092W 462 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 GTR2YGR163W 1026 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 RPA12YJR063W 378 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 AIM36YMR157C 768 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 RNP1YLL046C 750 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 HAP4YKL109W 1665 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 NCL1YBL024W 2055 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 BNA7YDR428C 786 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YJL169WYJL169W 369 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 CCL1YPR025C 1182 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 MON1YGL124C 1935 nt0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms