Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	STB4	YMR019W	2850 nt		0.18	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	PUS9	YDL036C	1389 nt		0.18	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	VPS9	YML097C	1356 nt		0.18	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	STN1	YDR082W	1485 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	SGO1	YOR073W	1773 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	ASM4	YDL088C	1587 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	YIL059C	YIL059C	366 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	TFA2	YKR062W	987 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	RIO2	YNL207W	1278 nt		0.17	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	SEC3	YER008C	4011 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	HIR3	YJR140C	4947 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	PPE1	YHR075C	1203 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	HIT1	YJR055W	495 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	RPL38	YLR325C	237 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	UBX4	YMR067C	1251 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	ATG5	YPL149W	885 nt		0.16	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	RLF2	YPR018W	1821 nt		0.15	□□□□□ -2.38
DDR2	P89113	YDL183C	YDL183C	963 nt		0.15	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	BTT1	YDR252W	450 nt		0.15	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		0.15	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	ARC18	YLR370C	537 nt		0.15	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	PAC1	YOR269W	1485 nt		0.15	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	SET4	YJL105W	1683 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	BDP1	YNL039W	1785 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	KAP122	YGL016W	3246 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RGI1	YER067W	486 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	BAG7	YOR134W	1230 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RKR1	YMR247C	4689 nt		0.14	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	SYH1	YPL105C	2550 nt		0.13	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	CTH1	YDR151C	978 nt		0.13	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	CUP9	YPL177C	921 nt		0.13	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	LTP1	YPR073C	486 nt		0.13	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	ULP2	YIL031W	3105 nt		0.13	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	HSE1	YHL002W	1359 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	NSE4	YDL105W	1209 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	NSE3	YDR288W	912 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	STF2	YGR008C	255 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	MCM22	YJR135C	720 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YLR053C	YLR053C	327 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YNL276C	YNL276C	396 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	MPD1	YOR288C	957 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	DSN1	YIR010W	1731 nt		0.12	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RRP6	YOR001W	2202 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	CDC39	YCR093W	6327 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	CGR1	YGL029W	363 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	HUB1	YNR032C-A	222 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YOR062C	YOR062C	807 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RXT2	YBR095C	1293 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	PET309	YLR067C	2898 nt		0.11	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YDL062W	YDL062W	426 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	SHR3	YDL212W	633 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RPC11	YDR045C	333 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	PCL6	YER059W	1263 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	MMF1	YIL051C	438 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	PEX12	YMR026C	1200 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YET2	YMR040W	483 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	IRC23	YOR044W	474 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YBR090C	YBR090C	369 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YDR338C	YDR338C	2088 nt		0.1	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	YDL073W	YDL073W	2955 nt		0.09	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	DGR2	YKL121W	2559 nt		0.09	□□□□□ -2.39
DDR2	P89113	RPS24B	YIL069C	408 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	ABF2	YMR072W	552 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	PEX27	YOR193W	1131 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	ALK1	YGL021W	2283 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SAC3	YDR159W	3906 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	FIG4	YNL325C	2640 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	AI1	Q0050	2505 nt		0.09	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	TRS65	YGR166W	1683 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	UTP20	YBL004W	7482 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	PPN1	YDR452W	2025 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	KEG1	YFR042W	603 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	TAD1	YGL243W	1203 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YGR039W	YGR039W	312 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YGR073C	YGR073C	372 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YGR190C	YGR190C	366 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YJL211C	YJL211C	444 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	RSM26	YJR101W	801 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	GRX7	YBR014C	612 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	SRL1	YOR247W	633 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	AZF1	YOR113W	2745 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	MVP1	YMR004W	1536 nt		0.08	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	TRM2	YKR056W	1920 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YNL054W-B	YNL054W-B	5250 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)B	tF(GAA)B	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	WIP1	YDR374W-A	270 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)F	tF(GAA)F	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)G	tF(GAA)G	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)H1	tF(GAA)H1	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)H2	tF(GAA)H2	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)M	tF(GAA)M	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)P1	tF(GAA)P1	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	tF(GAA)P2	tF(GAA)P2	73 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	EDC1	YGL222C	528 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	FIP1	YJR093C	984 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	IRC19	YLL033W	693 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	RNP1	YLL046C	750 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	RRP15	YPR143W	753 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	MUS81	YDR386W	1899 nt		0.07	□□□□□ -2.4
DDR2	P89113	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		0.07	□□□□□ -2.4

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