Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NECAP2Q9NVZ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms