Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDKN3Q16667 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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