Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HIF1AQ16665 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIF1AQ16665 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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