Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RPS17BYDR447C 411 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 RPL27BYDR471W 411 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 FYV4YHR059W 393 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SMD2YLR275W 333 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SME1YOR159C 285 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SPR2YOR214C 711 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 IST2YBR086C 2841 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SIR4YDR227W 4077 nt1.95□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 KAP123YER110C 3342 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SLU7YDR088C 1149 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 HTB1YDR224C 396 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 BRP1YGL007W 378 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YLR224WYLR224W 1110 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YBR051WYBR051W 351 nt1.94□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 ATP16YDL004W 483 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 GPN3YLR243W 819 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 RPS22BYLR367W 393 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SIP18YMR175W 240 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 VTI1YMR197C 654 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YBR197CYBR197C 654 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 AME1YBR211C 975 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 MES1YGR264C 2256 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 UTP5YDR398W 1932 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 LST4YKL176C 2487 nt1.93□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 NAB6YML117W 3405 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YCR099CYCR099C 468 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 NSE4YDL105W 1209 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 COX6YHR051W 447 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SMD3YLR147C 306 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 ARL1YBR164C 552 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YBR277CYBR277C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 NEO1YIL048W 3456 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 AGC1YPR021C 2709 nt1.92□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 PES4YFR023W 1836 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SET2YJL168C 2202 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 PIB1YDR313C 861 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 GEP7YGL057C 864 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 PRP38YGR075C 729 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 AIM19YIL087C 474 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 SUI2YJR007W 915 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 YBL012CYBL012C 402 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 MIX23YBL107C 591 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 TRM7YBR061C 933 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 MSS18YPR134W 807 nt1.91□□□□□ -2.1
SNF8Q12483 EST3YIL009C-A 546 nt1.9□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RMP1YLR145W 606 nt1.9□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.9□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 CDC37YDR168W 1521 nt1.9□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 CHC1YGL206C 4962 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YJL070CYJL070C 2667 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 CWC23YGL128C 852 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 EMP24YGL200C 612 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 THG1YGR024C 714 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 TMA10YLR327C 261 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YLR379WYLR379W 375 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 COX8YLR395C 237 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RPS16AYMR143W 432 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YMR144WYMR144W 1029 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YNR021WYNR021W 1215 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 CIN2YPL241C 807 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 PSO2YMR137C 1986 nt1.89□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YDR199WYDR199W 366 nt1.88□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 VMA7YGR020C 357 nt1.88□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.88□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RTT101YJL047C 2529 nt1.88□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 TUS1YLR425W 3924 nt1.88□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RRP6YOR001W 2202 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 ELG1YOR144C 2376 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SSF1YHR066W 1362 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 URK1YNR012W 1506 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SHS1YDL225W 1656 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 PRK1YIL095W 2433 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YFR057WYFR057W 456 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YGR226CYGR226C 210 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SPC2YML055W 537 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SWM2YNR004W 441 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SNF12YNR023W 1701 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 UBP2YOR124C 3819 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 ARR2YPR200C 393 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 GCN2YDR283C 4980 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 BPH1YCR032W 6504 nt1.87□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 VPH1YOR270C 2523 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YCR013CYCR013C 648 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 NTF2YER009W 378 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YPS5YGL259W 498 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 CAP1YKL007W 807 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 PAI3YMR174C 207 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SRL4YPL033C 846 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 UBR2YLR024C 5619 nt1.86□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 IPT1YDR072C 1584 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 IRC20YLR247C 4671 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YDL118WYDL118W 381 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YGL165CYGL165C 579 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YKR051WYKR051W 1257 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms