Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC63Q05C16 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms