Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 LEU3YLR451W 2661 nt0.42□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 RIM20YOR275C 1986 nt0.42□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 ERP3YDL018C 678 nt0.42□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 SPH1YLR313C 1593 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 YIL082WYIL082W 873 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 RPA12YJR063W 378 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 SEC22YLR268W 645 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 DBF20YPR111W 1695 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 LST4YKL176C 2487 nt0.41□□□□□ -2.34
TOM1Q03280 ORM2YLR350W 651 nt0.4□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 HPA2YPR193C 471 nt0.4□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPL32YBL092W 393 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 PNT1YOR266W 1272 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YBR277CYBR277C 402 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 PRP3YDR473C 1410 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 WHI3YNL197C 1986 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 FYV4YHR059W 393 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 DBP6YNR038W 1890 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YJL169WYJL169W 369 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 NDJ1YOL104C 1059 nt0.39□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPS18BYML026C 441 nt0.38□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YNL011CYNL011C 1335 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 KAR9YPL269W 1935 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPC11YDR045C 333 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 DYN3YMR299C 939 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 AIM9YER080W 1884 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RLM1YPL089C 2031 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 COX3Q0275 810 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 VAM6YDL077C 3150 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 PHO5YBR093C 1404 nt0.37□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPS17BYDR447C 411 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 KXD1YGL079W 657 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPS24BYIL069C 408 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 TMA7YLR262C-A 195 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 RPS17AYML024W 411 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 MCM21YDR318W 1107 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 PEP12YOR036W 867 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 INP2YMR163C 2118 nt0.36□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 COS7YDL248W 1152 nt0.35□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 HPA3YEL066W 540 nt0.35□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 SWI4YER111C 3282 nt0.35□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YBR062CYBR062C 543 nt0.35□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 IFH1YLR223C 3258 nt0.35□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 ATP22YDR350C 2055 nt0.34□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 FRK1YPL141C 2598 nt0.34□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 YDL073WYDL073W 2955 nt0.34□□□□□ -2.35
TOM1Q03280 DSS1YMR287C 2910 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 DUO1YGL061C 744 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 VOA1YGR106C 798 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 VMA10YHR039C-A 345 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 THI80YOR143C 960 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 CMR3YPR013C 954 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 CBP6YBR120C 489 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 PUF4YGL014W 2667 nt0.34□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YPS5YGL259W 498 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 LSM2YBL026W 288 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 TFB4YPR056W 1017 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 RIX1YHR197W 2292 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 URB2YJR041C 3525 nt0.33□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 VPS74YDR372C 1038 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YDL206WYDL206W 2289 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 SEC59YMR013C 1560 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 AVT5YBL089W 1380 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 AAR2YBL074C 1068 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 snR13snR13 124 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 MZM1YDR493W 372 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YGR190CYGR190C 366 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 RLP24YLR009W 600 nt0.32□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 MTL1YGR023W 1656 nt0.31□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 VIK1YPL253C 1944 nt0.31□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.31□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 POM152YMR129W 4014 nt0.31□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YGL177WYGL177W 348 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 ATG38YLR211C 681 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 URA5YML106W 681 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 SPC29YPL124W 762 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YBR238CYBR238C 2196 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 TOM70YNL121C 1854 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 RSM27YGR215W 333 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YGR219WYGR219W 342 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YNL179CYNL179C 438 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 TMA16YOR252W 537 nt0.3□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 HIR3YJR140C 4947 nt0.29□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 ALG11YNL048W 1647 nt0.29□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 CAF20YOR276W 486 nt0.28□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 AGC1YPR021C 2709 nt0.28□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 RPS16BYDL083C 432 nt0.28□□□□□ -2.36
TOM1Q03280 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.28□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 NCE101YJL205C 162 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 EDC1YGL222C 528 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 YGL242CYGL242C 546 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 COF1YLL050C 432 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 FCF2YLR051C 654 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 KAP122YGL016W 3246 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 STB4YMR019W 2850 nt0.27□□□□□ -2.37
TOM1Q03280 LYS14YDR034C 2373 nt0.27□□□□□ -2.37
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