Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SEC24CP53992 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SEC24CP53992 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC24CP53992 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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SEC24CP53992 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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SEC24CP53992 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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SEC24CP53992 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC24CP53992 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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