Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YGR053CYGR053C 852 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 KHA1YJL094C 2622 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 MRPL38YKL170W 417 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 ARV1YLR242C 966 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 COX8YLR395C 237 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 MDM1YML104C 3384 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 RPL16BYNL069C 597 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 YOL134CYOL134C 390 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 YBR032WYBR032W 303 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 SWD3YBR175W 948 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 NTC20YBR188C 423 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 MAL33YBR297W 1407 nt2.55□□□□□ -2
AVT5P38176 EPL1YFL024C 2499 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 RIX1YHR197W 2292 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 FRE2YKL220C 2136 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 DUF1YOL087C 3351 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 SPE1YKL184W 1401 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 FLO11YIR019C 4104 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 CDC26YFR036W 375 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 RTT102YGR275W 474 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 ILV5YLR355C 1188 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 SFM1YOR021C 642 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 ESL2YKR096W 3588 nt2.54□□□□□ -2
AVT5P38176 ATP22YDR350C 2055 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 BMH2YDR099W 822 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 SMB1YER029C 591 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 OTU2YHL013C 924 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 TCD1YHR003C 1290 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 NBL1YHR199C-A 222 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 RMP1YLR145W 606 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 YPL142CYPL142C 318 nt2.53□□□□□ -2
AVT5P38176 HFD1YMR110C 1599 nt2.53□□□□□ -2.01
AVT5P38176 SEN54YPL083C 1404 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 URB2YJR041C 3525 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YCR090CYCR090C 549 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RPL40BYKR094C 387 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YNL043CYNL043C 321 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 TIM12YBR091C 330 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 ITC1YGL133W 3795 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YCL019WYCL019W 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RPA190YOR341W 4995 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 MED1YPR070W 1701 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RSN1YMR266W 2862 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RMT2YDR465C 1239 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YGL042CYGL042C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YJR079WYJR079W 330 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YKL066WYKL066W 444 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RRD2YPL152W 1077 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YPL197CYPL197C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 MMS1YPR164W 4224 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RIF1YBR275C 5751 nt2.51□□□□□ -2.01
AVT5P38176 VAS1YGR094W 3315 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YCK2YNL154C 1641 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 STE23YLR389C 3084 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RPL27BYDR471W 411 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RRT13YER066W 558 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YER181CYER181C 324 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YGR242WYGR242W 309 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 PDS5YMR076C 3834 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RPL23AYBL087C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YPL225WYPL225W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 VID24YBR105C 1089 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YBR209WYBR209W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YKL100CYKL100C 1764 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 NMD2YHR077C 3270 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 MSL5YLR116W 1431 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 PRP8YHR165C 7242 nt2.5□□□□□ -2.01
AVT5P38176 NET1YJL076W 3570 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 JJJ2YJL162C 1752 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 VAC8YEL013W 1737 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YPS5YGL259W 498 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YLR302CYLR302C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 BSC3YLR465C 309 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 SMC2YFR031C 3513 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YLR001CYLR001C 2589 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 SLH1YGR271W 5904 nt2.49□□□□□ -2.01
AVT5P38176 ARK1YNL020C 1917 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 VHR2YER064C 1518 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 SRB4YER022W 2064 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 PDC2YDR081C 2778 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RPS22AYJL190C 393 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 RRT16YNL105W 429 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 OST2YOR103C 393 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 GPI17YDR434W 1605 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 BIT61YJL058C 1632 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 UBP15YMR304W 3693 nt2.48□□□□□ -2.01
AVT5P38176 TOM1YDR457W 9807 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms