Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFLP07196 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFLP07196 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFLP07196 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFLP07196 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFLP07196 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFLP07196 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms