Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV3-25P01717 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGLV3-25P01717 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms