Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAD1O00515 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAD1O00515 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAD1O00515 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAD1O00515 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms