Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHMG1C9JSJ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms