Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNIKQ9UKE5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms