Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC62Q6P9F0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC62Q6P9F0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms