Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC181Q5TID7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC181Q5TID7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms