Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP25-1Q3LHN0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms