Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ME3Q16798 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME3Q16798 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME3Q16798 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME3Q16798 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ME3Q16798 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME3Q16798 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ME3Q16798 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ME3Q16798 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ME3Q16798 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ME3Q16798 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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