Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC5P28715 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms