Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP69A5D8W1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms