Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP58Q9Y2X3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOP58Q9Y2X3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms