Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YNL057WYNL057W 333 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 APL6YGR261C 2430 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 YCR023CYCR023C 1836 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 AIP1YMR092C 1848 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 NHX1YDR456W 1902 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BRQ12217 ULP1YPL020C 1866 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 GAC1YOR178C 2382 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 TFB5YDR079C-A 219 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 ECT1YGR007W 972 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YBL028CYBL028C 321 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SOK2YMR016C 2358 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 PIN4YBL051C 2007 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 MIP6YHR015W 1980 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YLL007CYLL007C 1998 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YTA6YPL074W 2265 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YJR085CYJR085C 318 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 TIM8YJR135W-A 264 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 NTC20YBR188C 423 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 OAF3YKR064W 2592 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 DPB11YJL090C 2295 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 ELM1YKL048C 1923 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SSP1YHR184W 1716 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 EPO1YMR124W 2832 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 FLC1YPL221W 2382 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 ATP25YMR098C 1839 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 VID30YGL227W 2877 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 RPS24AYER074W 408 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YHR217CYHR217C 462 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 KEX1YGL203C 2190 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 GLN4YOR168W 2430 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 BIT61YJL058C 1632 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SRP68YPL243W 1800 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YHR078WYHR078W 1659 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 MES1YGR264C 2256 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YAP1802YGR241C 1707 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 ISW2YOR304W 3363 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 RPS23AYGR118W 438 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 RPS22BYLR367W 393 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 YPL062WYPL062W 405 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 SWC3YAL011W 1878 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 REB1YBR049C 2433 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BRQ12217 PHO2YDL106C 1680 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 MAK31YCR020C-A 267 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 PSF1YDR013W 627 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 CUP2YGL166W 678 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 ATP15YPL271W 189 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 MCH4YOL119C 1506 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SRB4YER022W 2064 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 EBS1YDR206W 2655 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 LHP1YDL051W 828 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 ASK10YGR097W 3441 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 DAP2YHR028C 2457 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 AIM9YER080W 1884 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SNU13YEL026W 381 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 INA22YIR024C 651 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 LSM1YJL124C 519 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 RFC3YNL290W 1023 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YBR224WYBR224W 516 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 CAF4YKR036C 1932 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YJL206CYJL206C 2277 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SPT10YJL127C 1923 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SMD1YGR074W 441 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YPL182CYPL182C 384 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 MMP1YLL061W 1752 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SED4YCR067C 3198 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 AVT1YJR001W 1809 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 CCT7YJL111W 1653 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YBL112CYBL112C 318 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 RDH54YBR073W 2877 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 SEC39YLR440C 2130 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 UBP12YJL197W 3765 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 HBT1YDL223C 3141 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 CHL1YPL008W 2586 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 snR60snR60 104 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 YFR035CYFR035C 345 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 RPS0AYGR214W 759 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 RRT15YLR162W-A 189 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 snR52snR52 92 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 NAM2YLR382C 2685 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 ALR2YFL050C 2577 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 MNR2YKL064W 2910 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-BRQ12217 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 YMR295CYMR295C 594 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 YFL034WYFL034W 3222 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 BUL1YMR275C 2931 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 KIN4YOR233W 2403 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 PCC1YKR095W-A 267 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 ECM16YMR128W 3804 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 YNL028WYNL028W 318 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 RPS9AYPL081W 594 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BRQ12217 AFT1YGL071W 2073 nt4.64□□□□□ -1.67
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