Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YNL226WYNL226W 411 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PBS2YJL128C 2007 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 CDC37YDR168W 1521 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC28P40509 MFB1YDR219C 1398 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YCT1YLL055W 1596 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PTP3YER075C 2787 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 PDR1YGL013C 3207 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 ORC2YBR060C 1863 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YGR050CYGR050C 357 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 COX3Q0275 810 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YLL044WYLL044W 447 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YPT6YLR262C 648 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 IPP1YBR011C 864 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 KRE33YNL132W 3171 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 TRZ1YKR079C 2517 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC28P40509 NUM1YDR150W 8247 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RGA2YDR379W 3030 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 UBP16YPL072W 1500 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YCR013CYCR013C 648 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 ADK1YDR226W 669 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RNR2YJL026W 1200 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YJL202CYJL202C 348 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RNP1YLL046C 750 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RPL36AYMR194W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YOR331CYOR331C 558 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SUS1YBR111W-A 291 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YLR001CYLR001C 2589 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SKP2YNL311C 2292 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 SWA2YDR320C 2007 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RSE1YML049C 4086 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RSM28YDR494W 1086 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YEA4YEL004W 1029 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 NTF2YER009W 378 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YLR217WYLR217W 324 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YLR366WYLR366W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 RCE1YMR274C 948 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 YBR051WYBR051W 351 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC28P40509 VPS38YLR360W 1320 nt2.59□□□□□ -2
SEC28P40509 SHS1YDL225W 1656 nt2.59□□□□□ -2
SEC28P40509 SAK1YER129W 3429 nt2.59□□□□□ -2
SEC28P40509 HAA1YPR008W 2085 nt2.59□□□□□ -2
SEC28P40509 NPR1YNL183C 2373 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 UBC13YDR092W 462 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 LOC1YFR001W 615 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 COX8YLR395C 237 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 END3YNL084C 1050 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 SIR3YLR442C 2937 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 HRD3YLR207W 2502 nt2.58□□□□□ -2
SEC28P40509 PHO2YDL106C 1680 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 MES1YGR264C 2256 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 CKA1YIL035C 1119 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 GPI14YJR013W 1212 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 VPH2YKL119C 648 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 VPS63YLR261C 327 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 PEP12YOR036W 867 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 MRD1YPR112C 2664 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 AYT1YLL063C 1425 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 YIL166CYIL166C 1629 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 DAL5YJR152W 1632 nt2.57□□□□□ -2
SEC28P40509 YNL018CYNL018C 1839 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 VPS13YLL040C 9435 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 HOS4YIL112W 3252 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 GLC7YER133W 939 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 MPO1YGL010W 525 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 INP51YIL002C 2841 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 JIP5YPR169W 1479 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 UTP15YMR093W 1542 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 GPI17YDR434W 1605 nt2.56□□□□□ -2
SEC28P40509 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.55□□□□□ -2
SEC28P40509 BAS1YKR099W 2436 nt2.55□□□□□ -2
SEC28P40509 RPS16AYMR143W 432 nt2.55□□□□□ -2
SEC28P40509 SFM1YOR021C 642 nt2.55□□□□□ -2
SEC28P40509 UBX3YDL091C 1368 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 FKS3YMR306W 5358 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 TAD1YGL243W 1203 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 YGR293CYGR293C 462 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 ASG7YJL170C 630 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 RPC25YKL144C 639 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 PRE8YML092C 753 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 BRX1YOL077C 876 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 SME1YOR159C 285 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 ARP8YOR141C 2646 nt2.54□□□□□ -2
SEC28P40509 ROY1YMR258C 1662 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 CTF13YMR094W 1437 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 PSK2YOL045W 3306 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 RPS17BYDR447C 411 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 FYV4YHR059W 393 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 LIN1YHR156C 1023 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 SEC28YIL076W 891 nt2.53□□□□□ -2
SEC28P40509 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.53□□□□□ -2
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