Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGM1P36871 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGM1P36871 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGM1P36871 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGM1P36871 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGM1P36871 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGM1P36871 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGM1P36871 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms