Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC93Q567U6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms