Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 GIS4YML006C 2325 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 MAK21YDR060W 3078 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YFL065CYFL065C 309 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 LIF1YGL090W 1266 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YIL175WYIL175W 318 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 PDP3YLR455W 915 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 NGL1YOL042W 1092 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YOL159CYOL159C 516 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SRL1YOR247W 633 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SVS1YPL163C 783 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 snR35snR35 204 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 BEM4YPL161C 1902 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 STU2YLR045C 2667 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ROM1YGR070W 3468 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 AVT2YEL064C 1443 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 DBP10YDL031W 2988 nt3.69□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CIN1YOR349W 3045 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 IOC3YFR013W 2364 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ECO1YFR027W 846 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 VMA10YHR039C-A 345 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPA12YJR063W 378 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 VPS63YLR261C 327 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR297WYLR297W 390 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CTK3YML112W 891 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SHH3YMR118C 591 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 GOT1YMR292W 417 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YNL089CYNL089C 477 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YBR051WYBR051W 351 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YDL176WYDL176W 2127 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YMR317WYMR317W 3423 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPA190YOR341W 4995 nt3.68□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 AUS1YOR011W 4185 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 MET10YFR030W 3108 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 PHO81YGR233C 3537 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YDR008CYDR008C 351 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YHR125WYHR125W 306 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YJR011CYJR011C 786 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SEC22YLR268W 645 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ATX1YNL259C 222 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPS7AYOR096W 573 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YOR248WYOR248W 303 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 NTO1YPR031W 2247 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SHE4YOR035C 2370 nt3.67□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ENA5YDR038C 3276 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 VBA4YDR119W 2307 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CDC40YDR364C 1368 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YHR080CYHR080C 4038 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 PSF1YDR013W 627 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPS23AYGR118W 438 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CMC2YBL059C-A 330 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPS23BYPR132W 438 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 MBA1YBR185C 837 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 snR42snR42 351 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SLK19YOR195W 2466 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CHO2YGR157W 2610 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 XRN1YGL173C 4587 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 NDC80YIL144W 2076 nt3.66□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 SWC4YGR002C 1431 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SRD1YCR018C 666 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 EMI1YDR512C 564 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YDR537CYDR537C 606 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YGR073CYGR073C 372 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 ECL1YGR146C 636 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPL6BYLR448W 531 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YPR096CYPR096C 303 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 GPX2YBR244W 489 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 EMP70YLR083C 2004 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 BRE5YNR051C 1548 nt3.65□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SMC3YJL074C 3693 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RED1YLR263W 2484 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 FAP7YDL166C 594 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 AIM11YER093C-A 414 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPL11BYGR085C 525 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPS21BYJL136C 264 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YLR101CYLR101C 396 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPS16AYMR143W 432 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 INO4YOL108C 456 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPL11AYPR102C 525 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 AIM4YBR194W 372 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 STE6YKL209C 3873 nt3.64□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YKR078WYKR078W 1758 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 BMS1YPL217C 3552 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 UBP5YER144C 2418 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 STP2YHR006W 1626 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 NOP4YPL043W 2058 nt3.63□□□□□ -1.83
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