Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00205P59089 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms