Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE4Q8N205 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms