Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
WDR88Q6ZMY6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
WDR88Q6ZMY6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms