Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YIL029CYIL029C 429 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 YIR040CYIR040C 333 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 ANB1YJR047C 474 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 ILM1YJR118C 612 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 TDA8YAL064C-A 381 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 YAR062WYAR062W 597 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 TPK2YPL203W 1143 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 TFC1YBR123C 1950 nt3.59□□□□□ -1.83
SLX4Q12098 AVT2YEL064C 1443 nt3.59□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 VPS30YPL120W 1674 nt3.59□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SCEIQ0160 708 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 MRPL38YKL170W 417 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 RPS28BYLR264W 204 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SHH3YMR118C 591 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 RPL23AYBL087C 414 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YBR051WYBR051W 351 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YBR062CYBR062C 543 nt3.58□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YCR108CYCR108C 192 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SNA4YDL123W 423 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 NGL1YOL042W 1092 nt3.57□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 RIX1YHR197W 2292 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 KAR9YPL269W 1935 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SMC3YJL074C 3693 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ARO1YDR127W 4767 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SWC4YGR002C 1431 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 MAL33YBR297W 1407 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 GAL80YML051W 1308 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 OPI6YDL096C 327 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 DLS1YJL065C 504 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ACF4YJR083C 930 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 GOT1YMR292W 417 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 MDN1YLR106C 14733 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YCL019WYCL019W 5313 nt3.56□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 PCK1YKR097W 1650 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YNL193WYNL193W 1677 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 TFB1YDR311W 1929 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ARK1YNL020C 1917 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 UBX4YMR067C 1251 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YMR181CYMR181C 465 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YNL203CYNL203C 612 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ATP19YOL077W-A 207 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SCY1YGL083W 2415 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SLP1YOR154W 1764 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 MED1YPR070W 1701 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ERG11YHR007C 1593 nt3.55□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 NCS2YNL119W 1482 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 DOA4YDR069C 2781 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 PSK1YAL017W 4071 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YKL100CYKL100C 1764 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 CDH1YGL003C 1701 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 CIC1YHR052W 1131 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 COX23YHR116W 456 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YJL086CYJL086C 369 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SWS2YNL081C 432 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SFM1YOR021C 642 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 PET123YOR158W 957 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 PKH1YDR490C 2301 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 DSF2YBR007C 2211 nt3.54□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 AKR1YDR264C 2295 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 BIT61YJL058C 1632 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 snR59snR59 78 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 CHZ1YER030W 462 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YGL082WYGL082W 1146 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 CPR7YJR032W 1182 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 EAF6YJR082C 342 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 CSE4YKL049C 690 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YLR224WYLR224W 1110 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 YNL043CYNL043C 321 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 SPR3YGR059W 1539 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 ADY4YLR227C 1482 nt3.53□□□□□ -1.84
SLX4Q12098 TCP1YDR212W 1680 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 YCK2YNL154C 1641 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 YDR090CYDR090C 933 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 VPS74YDR372C 1038 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 MCR1YKL150W 909 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 CDC123YLR215C 1083 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 PDP3YLR455W 915 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 RRT16YNL105W 429 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 TOA1YOR194C 861 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 UTP15YMR093W 1542 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 RPN1YHR027C 2982 nt3.52□□□□□ -1.85
SLX4Q12098 SSP1YHR184W 1716 nt3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.5 ms