Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 MDM36YPR083W 1740 nt2.68□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 CST9YLR394W 1449 nt2.68□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 UBP8YMR223W 1416 nt2.68□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.68□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.68□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 ROM1YGR070W 3468 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 TPO5YKL174C 1857 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 LCB4YOR171C 1875 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 AVT5YBL089W 1380 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YDL242WYDL242W 354 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 ATC1YDR184C 885 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 RTT105YER104W 627 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 RSM27YGR215W 333 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 CTK2YJL006C 972 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YJL032WYJL032W 315 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YJL114WYJL114W 681 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 HSC82YMR186W 2118 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YNL276CYNL276C 396 nt2.67□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 PRP8YHR165C 7242 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 UFD4YKL010C 4452 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 POL4YCR014C 1749 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 HTB1YDR224C 396 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 DIG2YDR480W 972 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YMR141CYMR141C 309 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 IPP1YBR011C 864 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YPR027CYPR027C 834 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 LTP1YPR073C 486 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YBR090CYBR090C 369 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 snR35snR35 204 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 PUF6YDR496C 1971 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 VPS3YDR495C 3036 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 IOC3YFR013W 2364 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 TIF4631YGR162W 2859 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 YNL011CYNL011C 1335 nt2.66□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 TFC1YBR123C 1950 nt2.65□□□□□ -1.98
SLM3Q12093 CWC23YGL128C 852 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 LST7YGR057C 729 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 GTR2YGR163W 1026 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 TCD1YHR003C 1290 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 VMA10YHR039C-A 345 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SRL3YKR091W 741 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 ATG10YLL042C 504 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 RPL6BYLR448W 531 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 FAR3YMR052W 615 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YNL109WYNL109W 546 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MER1YNL210W 813 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 GCY1YOR120W 939 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MAK21YDR060W 3078 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 AEP1YMR064W 1557 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 TRM82YDR165W 1335 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SPP382YLR424W 2127 nt2.65□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SRP1YNL189W 1629 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 PHO81YGR233C 3537 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 DOA4YDR069C 2781 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 CCT7YJL111W 1653 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 PEX5YDR244W 1839 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 NGG1YDR176W 2109 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 OST6YML019W 999 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MGE1YOR232W 687 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 BTS1YPL069C 1008 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YFR016CYFR016C 3702 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 GAL80YML051W 1308 nt2.64□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 EAP1YKL204W 1899 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SEC16YPL085W 6588 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 ICR1ICR1 3199 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 ATP16YDL004W 483 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 NRG1YDR043C 696 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 EFG1YGR271C-A 702 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YIL141WYIL141W 390 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SUB1YMR039C 879 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YPL142CYPL142C 318 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SOK1YDR006C 2706 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 AI2Q0055 2565 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 RIX1YHR197W 2292 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MSH4YFL003C 2637 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SSD1YDR293C 3753 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 ESA1YOR244W 1338 nt2.63□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 MUB1YMR100W 1863 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YJR098CYJR098C 1971 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 GPI19YDR437W 423 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 IKI1YHR187W 930 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 RPC25YKL144C 639 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SAS2YMR127C 1017 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 HUA2YOR284W 732 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 ATP22YDR350C 2055 nt2.62□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YAT2YER024W 2772 nt2.61□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 BNI4YNL233W 2679 nt2.61□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SPO71YDR104C 3738 nt2.61□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 SLD5YDR489W 885 nt2.61□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YHR212CYHR212C 336 nt2.61□□□□□ -1.99
SLM3Q12093 YKL115CYKL115C 393 nt2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 127.4 ms