Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00205P59089 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms