Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YNL089CYNL089C 477 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YOL134CYOL134C 390 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 MRPL40YPL173W 894 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 RPC40YPR110C 1008 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 AYT1YLL063C 1425 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 ANR2YKL047W 1551 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 RSE1YML049C 4086 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 PTP3YER075C 2787 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YBP2YGL060W 1926 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TRM2YKR056W 1920 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 ORC2YBR060C 1863 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YBR013CYBR013C 390 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TFB6YOR352W 1032 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 PIS1YPR113W 663 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 SLN1YIL147C 3663 nt2.29□□□□□ -2.04
DDI1P40087 SEC16YPL085W 6588 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 PIG2YIL045W 1617 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 SHR3YDL212W 633 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TVP15YDR100W 432 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YGL204CYGL204C 306 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 MIG2YGL209W 1149 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 MVB12YGR206W 306 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 NOP19YGR251W 591 nt2.28□□□□□ -2.04
DDI1P40087 PEX4YGR133W 552 nt2.27□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YJL032WYJL032W 315 nt2.27□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.27□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.27□□□□□ -2.05
DDI1P40087 AIM32YML050W 936 nt2.27□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RTG3YBL103C 1461 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SLF1YDR515W 1344 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ERG28YER044C 447 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YGR018CYGR018C 330 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 GOS1YHL031C 672 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YIL012WYIL012W 342 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YLR169WYLR169W 354 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YML090WYML090W 387 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 FPR1YNL135C 345 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ISU1YPL135W 498 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YPR014CYPR014C 330 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ALG14YBR070C 714 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 VMA9YCL005W-A 222 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YLR108CYLR108C 1458 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.26□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YJL132WYJL132W 2253 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 APC2YLR127C 2562 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 STE11YLR362W 2154 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 AMS1YGL156W 3252 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RPN9YDR427W 1182 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RNR2YJL026W 1200 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ARF3YOR094W 552 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 NTC20YBR188C 423 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SSD1YDR293C 3753 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SRB4YER022W 2064 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SCD5YOR329C 2619 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 BUB1YGR188C 3066 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 TRS130YMR218C 3309 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YPP1YGR198W 2454 nt2.25□□□□□ -2.05
DDI1P40087 NEL1YHR035W 1893 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 FAR11YNL127W 2862 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 IRA2YOL081W 9240 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SRD1YCR018C 666 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YGL117WYGL117W 798 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YGL242CYGL242C 546 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ERG25YGR060W 930 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RTS3YGR161C 792 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YLR050CYLR050C 486 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YKE2YLR200W 345 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YOR050CYOR050C 348 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YOR097CYOR097C 528 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 HUA2YOR284W 732 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 snR191snR191 274 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 TOR1YJR066W 7413 nt2.24□□□□□ -2.05
DDI1P40087 SPB1YCL054W 2526 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RPL27BYDR471W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YKL069WYKL069W 543 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 RPS29AYLR388W 171 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 DIA1YMR316W 1011 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YOL107WYOL107W 1029 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 MSN1YOL116W 1149 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YOR331CYOR331C 558 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 TYE7YOR344C 876 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YBR090CYBR090C 369 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ASI3YNL008C 2031 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 VPS64YDR200C 1815 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 MAK11YKL021C 1407 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 MAL33YBR297W 1407 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 STH1YIL126W 4080 nt2.23□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YCR016WYCR016W 873 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YCR064CYCR064C 411 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 KEI1YDR367W 666 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 GUK1YDR454C 564 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 YAL037WYAL037W 804 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 HEM4YOR278W 828 nt2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84 ms