Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPCDR1Q9BY65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPCDR1Q9BY65 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms