Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRYD3Q8NCJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRYD3Q8NCJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms