Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHLDB3Q6NSJ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms