Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME3Q16798 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME3Q16798 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME3Q16798 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME3Q16798 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ME3Q16798 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME3Q16798 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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