Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YML040WYML040W 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YML045W-AYML045W-A 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YMR051CYMR051C 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 HMO1YDR174W 741 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 DAD4YDR320C-A 219 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YDR537CYDR537C 606 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 TFA2YKR062W 987 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YKR075CYKR075C 924 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 RSA3YLR221C 663 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YML094C-AYML094C-A 402 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 PDR8YLR266C 2106 nt1.72□□□□□ -2.13
RTR2Q12378 CBS2YDR197W 1170 nt1.71□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 IRC6YFR043C 714 nt1.71□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YGR168CYGR168C 1131 nt1.71□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 APD1YBR151W 951 nt1.71□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YNL144CYNL144C 2223 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 IRA1YBR140C 9279 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MIG2YGL209W 1149 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 CTK1YKL139W 1587 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RLP24YLR009W 600 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YAR075WYAR075W 474 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RPS17AYML024W 411 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 SIP18YMR175W 240 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 PUS9YDL036C 1389 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 GIP3YPL137C 3831 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YIL092WYIL092W 1902 nt1.7□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 UTP6YDR449C 1323 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 AGE1YDR524C 1449 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YDR203WYDR203W 318 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RSM26YJR101W 801 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 CSE4YKL049C 690 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 URA5YML106W 681 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MED11YMR112C 396 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 TPT1YOL102C 693 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 SPS4YOR313C 1017 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 PEX8YGR077C 1770 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MGA2YIR033W 3342 nt1.69□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 AEP3YPL005W 1821 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 IRC20YLR247C 4671 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 PKH3YDR466W 2697 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 SEN54YPL083C 1404 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YCR013CYCR013C 648 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 STE2YFL026W 1296 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 TWF1YGR080W 999 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MRPL6YHR147C 645 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 NNF1YJR112W 606 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 LIP2YLR239C 987 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YBL028CYBL028C 321 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 UBR1YGR184C 5853 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 HUL5YGL141W 2733 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 CLG1YGL215W 1359 nt1.68□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 IRC10YOL015W 1761 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 HOS4YIL112W 3252 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MPS1YDL028C 2295 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YDL241WYDL241W 372 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RRP1YDR087C 837 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 NOP19YGR251W 591 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 SNX4YJL036W 1272 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 LCL2YLR104W 396 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 ADI1YMR009W 540 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 IRC21YMR073C 606 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 VPS15YBR097W 4365 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 PEX5YDR244W 1839 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 STN1YDR082W 1485 nt1.67□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 REV1YOR346W 2958 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 TSC13YDL015C 933 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RTN1YDR233C 888 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 RPL16BYNL069C 597 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 MSL5YLR116W 1431 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 VPS38YLR360W 1320 nt1.66□□□□□ -2.14
RTR2Q12378 VPS34YLR240W 2628 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 YLR108CYLR108C 1458 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 GPI8YDR331W 1236 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 PHO92YDR374C 921 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 ADH4YGL256W 1149 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 RPL36AYMR194W 303 nt1.65□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 SDC25YLL016W 3147 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 YEL075CYEL075C 369 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 PMI40YER003C 1290 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 ISC10YER180C 804 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 CAB2YIL083C 1098 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 RPA34YJL148W 702 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 SYM1YLR251W 594 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 NPR1YNL183C 2373 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 RTT107YHR154W 3213 nt1.64□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 YOL114CYOL114C 609 nt1.63□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 HUA2YOR284W 732 nt1.63□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 ATP22YDR350C 2055 nt1.63□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 YBR259WYBR259W 2067 nt1.63□□□□□ -2.15
RTR2Q12378 MYO2YOR326W 4725 nt1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.1 ms