Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YFL015CYFL015C 495 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CDC123YLR215C 1083 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 MER1YNL210W 813 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 TSR4YOL022C 1227 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 snR24snR24 89 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 DBP10YDL031W 2988 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 ADY4YLR227C 1482 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 PEX6YNL329C 3093 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 MSB2YGR014W 3921 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 BOI1YBL085W 2943 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SAP1YER047C 2694 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YHR078WYHR078W 1659 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 URB2YJR041C 3525 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 DPP1YDR284C 870 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 MFA1YDR461W 111 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RSM27YGR215W 333 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 BAT1YHR208W 1182 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YJL169WYJL169W 369 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 PRE8YML092C 753 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YNL050CYNL050C 813 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 PEX27YOR193W 1131 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RRD2YPL152W 1077 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YPL150WYPL150W 2706 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 NSA1YGL111W 1392 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 STN1YDR082W 1485 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 PEX5YDR244W 1839 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CAF120YNL278W 3183 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 GEA1YJR031C 4227 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CYR1YJL005W 6081 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 MAM1YER106W 909 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SEC4YFL005W 648 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YFL012WYFL012W 447 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YIP5YGL161C 933 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CTK2YJL006C 972 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 GPI14YJR013W 1212 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 MCR1YKL150W 909 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YJL049WYJL049W 1353 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SAG1YJR004C 1953 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SKT5YBL061C 2091 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 SKP2YNL311C 2292 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 AVT2YEL064C 1443 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 AYT1YLL063C 1425 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 FLO11YIR019C 4104 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 ATP16YDL004W 483 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CUP9YPL177C 921 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 AFT2YPL202C 1251 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YPL276WYPL276W 438 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 AIM4YBR194W 372 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 KHA1YJL094C 2622 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 VAC14YLR386W 2643 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RPL17BYJL177W 555 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 NNF1YJR112W 606 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 VPS64YDR200C 1815 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.67□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 VHR1YIL056W 1923 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 GPM2YDL021W 936 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YDL158CYDL158C 309 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 TVP15YDR100W 432 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 COG7YGL005C 840 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RPL14BYHL001W 417 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YKL070WYKL070W 510 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 INO4YOL108C 456 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 ATP20YPR020W 348 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 RFC5YBR087W 1065 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YOL057WYOL057W 2136 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YJL132WYJL132W 2253 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 CDC55YGL190C 1581 nt2.66□□□□□ -1.98
LDB17Q12342 YDR209CYDR209C 414 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 BTN2YGR142W 1233 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SPO11YHL022C 1197 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YKL066WYKL066W 444 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 PRM6YML047C 1059 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RCE1YMR274C 948 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 HSP10YOR020C 321 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MGE1YOR232W 687 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RRG7YOR305W 729 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RRG8YPR116W 834 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SEN54YPL083C 1404 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 TRM82YDR165W 1335 nt2.65□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 NAB3YPL190C 2409 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 DUG2YBR281C 2637 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 NFT1YKR103W 3657 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RPL13AYDL082W 600 nt2.64□□□□□ -1.99
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