Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSNK1A1P48729 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSNK1A1P48729 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms