Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KRW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KRW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KRW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3KRW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3KRW8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3KRW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KRW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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